末流门派掌门君常笑，万万没想到：随便招来的高冷女弟子深藏不露，路上闭眼救的男弟子竟是第一天才，踢个球把重生后的武帝踢到怀疑人生，看着废物的小弟是个陨落的天才……这个宗门，全是妖孽啊…上苍要我末流门派逆天，挡不住啊...
千年前，神将飞蓬与魔尊重楼于新仙界中大战，神剑“照胆”跌落人间，飞蓬被贬下凡。千年后，蜀山锁妖塔震荡，获得魔剑的飞蓬转世——景天，与唐雪见、徐长卿及紫萱几人开始了一场为收集五灵珠封印锁妖塔的冒险。
镇西侯府小公子百里东君离家出走、闯荡江湖，未曾想卷入是非漩涡，师父古尘身死、家族备受皇室忌惮，江湖的残酷展现在少年的眼前。为了寻找自己的道路、守护重要的人，百里东君随此前结交的北离八公子前往天启城稷下学堂习武。在那里，百里东君与至交好友叶鼎之相识，成为了天下第一李长生的弟子，遇到了很多后来将改变他一生的人物，开启了他的江湖传奇……
以妖魔之血为墨，以百妖谱为卷，可摹画其形，夺其神通。姜月初一朝醒来，却变身成了盛世大唐的一介少女；在这长安月下，繁华与腐朽共生，仙佛绝迹，妖魔横行；所幸斩杀生物便能增长道行，将妖魔一一绘入妖谱，化作自身的力量；姜月初开始了斩妖夺神通，以绝色之姿镇压万古妖魔之路，逐渐揭开这个世界的迷雾。
大林郡世家出身的林凡本是得到天骄令的绝世天才，却被未婚妻夺走武魂，沦为废物。当来历莫测的大魔寄生林凡身上，重新激活了他被废的武魂，使他成为稀有的双武魂体质，至此，林凡正式踏上崛起之路，从小小郡城，闯上诸天万界。
天神星的危机尚未解除，新的威胁却又紧接而来… 大天神众人被龙牙兵层层包围之际，在魔化器的催生之下，恶狗将军降世了！ 靠着恶狗将军压倒性的黑暗力量，不但天神星众人都被邪恶势力给制服，更糟的是，魔化器将大天神为首的众人都加以复制出了邪恶的版本。 飞碟城里出现了一个神秘的人物，他不但向众人发动攻击，更强行带走了水魔！麻烦的是，受到攻击的星猫中毒了，只有薇薇的净化之力可以为星猫解毒。虽然薇薇然对自己的能力没有信心而不愿意尝试，但是在众人的信赖和鼓励下，薇薇最后不但救了星猫，更成功的掌握了净化之力。 阿修和蜻蜓怪激烈的缠斗着。激战中，蜻蜓怪再次进化成蛇怪….
故事延续第二季主线，灵界与斗魂卫在利益纠葛之下冲突不断，本季灵界派出强盛军队欲对斗魂卫赶尽杀绝，两方势力都在以正在举办门宗大会的五法山为中心汇集，在这里发生着惨烈的战斗与冲突。
