故事延续第二季主线，灵界与斗魂卫在利益纠葛之下冲突不断，本季灵界派出强盛军队欲对斗魂卫赶尽杀绝，两方势力都在以正在举办门宗大会的五法山为中心汇集，在这里发生着惨烈的战斗与冲突。
内详
最强神医混都市
《万古神帝》改编自阅文白金作家飞天鱼的同名小说。 八百年前，张若尘身为明帝独子，天资绝世却遭青梅竹马的池瑶公主斩杀；八百年后，他重生在云武郡国的废柴九王子“张若尘”体内，这具身体体弱多病、毫无灵力，与母亲林妃在郡王府备受欺凌。觉醒记忆后，张若尘立誓向已是昆仑界主宰的池瑶女皇复仇，同时守护给予他母爱的林妃。他觉醒时空神武印记，凭前世经验和努力快速成长，岁末考核夺冠后，历经武市斗场厮杀、地府门截杀，进入武市学宫深造。
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